Zoopedia é uma série pré-escolar 2D para crianças de quatro a seis anos que acompanha Cauê, Rani, Guigo e Mara, jovens amigos que estudam na mesma classe. Ao descobrirem uma sala secreta na biblioteca da escola, eles conhecem Lili, a enciclopédia mágica falante, e sua amiga Tita, a ampulheta. Juntos, vivenciam aventuras emocionantes nas páginas de Lili, explorando diferentes ilhas e ecossistemas enquanto aprendem sobre a vida dos animais que habitam esses lugares.

Ao longo das viagens, amizades são feitas, fotografias são registradas e músicas são compostas, tornando a enciclopédia ainda mais rica e ajudando a reforçar o aprendizado dos protagonistas.